ไมโครทูบูลยังเป็นส่วนประกอบสำคัญของโครงสร้างเซลล์ยูคาริโอตพิเศษอีก 3 ชนิด ได้แก่ แฟลกเจลลา ซิเลีย และเซนโทรโซม คุณอาจจำได้ว่า โครงร่างเซลล์ โปรคาริโอตเพื่อนของเราก็มีโครงสร้างที่มีแฟลกเจลลาซึ่งพวกมันใช้ในการเคลื่อนที่ อย่าสับสน แฟลเจลลายูคาริโอตที่เรากำลังจะกล่าวถึงมีบทบาทค่อนข้างเหมือนกัน แต่มีโครงสร้างที่แตกต่างกันมาก